德国的生物信息学怎么样?

毕筱闵毕筱闵最佳答案最佳答案

我在柏林大学生物信息学专业(BIFS),这个学期我们学了生物统计和计算机辅助设计(CAD)。因为本人是理工科背景 所以可能回答的问题比较专业 欢迎指正!

生物统计这门课是我们这个学期的新开课程之一,授课老师是专门研究遗传学的教授 Dr. Holzmann,他给咱们上了关于统计方法的基本概念,然后给了几个例子让咱们去实践这些统计知识。比如说,现在有一个基因数据说某个基因的区域与智力有关联,那么如何根据这一结果得出智力与这个基因相关的结论呢?首先需要建立一个模型来表示一个人的智力和他的基因表达量之间的关系,然后再通过计算得到两个样本的关联系数等等。最后得出的结论虽然不是很精确但是大致方向是正确的。

其实生物统计是一门应用统计学的方法在生物学中进行分析的一门学科。很多的研究都需要运用生物统计的知识对数据进行分析和建模。因此学好生物统计对于以后想继续在生物信息、基因组或者其他需要使用统计分析方法的科研方向都是非常有用的。

另外,我们还有门选修课叫做"R for Biologists”,讲师是位统计方面非常厉害的PhD,已经出了两本书了。主要内容是讲解如何使用编程语言 R 在生物信息学分析里面。比如如何画出优美流畅的图,如何建立不同的模型并进行参数估计,以及如何用 R 实现各种各样的算法。因为之前没有系统学习过编程所以我上这门课时感觉学习到了很多东西,也让我对将来如何使用 R 有初步的概念并且产生了浓厚的兴趣。 至于 CAD 这门课讲的是利用计算机辅助进行实验设计和数据分析。主要讲了关于化学结构和分子动力学模拟的一些基础知识,还有如何运用一个叫做ChemBioFuels的软件来帮助我们设计合成新的催化剂以及如何运用Qiagen’s Genespark来进行初步的数据分析。

在这门课上我学会了如何阅读一个化学结构的文献,如何把一个复杂分子的结构加以简单化从而可以进行分子动力学的模拟,以及如何运用一些基本的数理统计的知识对所得到的数据进行分析并对未来的实验给出建议等。这门课程让我们熟悉了如何将一门科研中所涉及到的理论知识运用到实际当中去,并且掌握了如何将不同知识点结合在一起进行深入的分析。

目前我对这两门课所学习到知识进行总结后大概是这样的: 以上只是我个人的一些见解,由于本人水平有限所以不足之处请大家多多包涵。谢谢!

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